UK

TARBP1

TARBP1 (англ. TAR (HIV-1) RNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 621 амінокислот, а молекулярна маса — 181 675[4].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEWVLAEALL SQSRDPRALL GALCQGEASA ERVETLRFLL QRLEDEEARG
SGGAGALPEA AREVAAGYLV PLLRSLRGRP AGGPDPSLQP RHRRRVLRAA
GAALRSCVRL AGRPQLAAAL AEEALRDLLA GWRAPGAEAA VEVLAAVGPC
LRPREDGPLL ERVAGTAVAL ALGGGGDGDE AGPAEDAAAL VAGRLLPVLV
QCGGAALRAV WGGLAAPGAS LGSGRVEEKL LVLSALAEKL LPEPGGDRAR
GAREAGPDAR RCWRFWRTVQ AGLGQADALT RKRARYLLQR AVEVSAELGA
DCTCGPQEGN GPSLFWWSER KKDELLKFWE NYILIMETLE GNQIHVIKPV
LPKLNNLFEY AVSEENGCWL FHPSWHMCIY KRMFESENKI LSKEGVIHFL
ELYETKILPF SPEFSEFIIG PLMDALSESS LYSRSPGQPI GSCSPLGLKL
QKFLVTYISL LPEEIKSSFL LKFIRKMTSR HWCAVPILFL SKALANVPRH
KALGIDGLLA LRDVIHCTMI THQILLRGAA QCYLLQTAMN LLDVEKVSLS
DVSTFLMSLR QEESLGRGTS LWTELCDWLR VNESYFKPSP TCSSIGLHKT
SLNAYVKSIV QEYVKSSAWE TGENCFMPDW FEAKLVSLMV LLAVDVEGMK
TQYSGKQRTE NVLRIFLDPL LDVLMKFSTN AYMPLLKTDR CLQLLLKLLN
TCRLKGSSAQ DDEVSTVLQN FFMSTTESIS EFILRRLTMN ELNSVSDLDR
CHLYLMVLTE LINLHLKVGW KRGNPIWRVI SLLKNASIQH LQEMDSGQEP
TVGSQIQRVV SMAALAMVCE AIDQKPELQL DSLHAGPLES FLSSLQLNQT
LQKPHAEEQS SYAHPLECSS VLEESSSSQG WGKIVAQYIH DQWVCLSFLL
KKYHTLIPTT GSEILEPFLP AVQMPIRTLQ SALEALTVLS SDQVLPVFHC
LKVLVPKLLT SSESLCIESF DMAWKIISSL SNTQLIFWAN LKAFVQFVFD
NKVLTIAAKI KGQAYFKIKE IMYKIIEMSA IKTGVFNTLI SYCCQSWIVS
ASNVSQGSLS SAKNYSELIL EACIFGTVFR RDQRLVQDVQ TFIENLGHDC
AANIVMENTK REDHYVRICA VKFLCLLDGS NMSHKLFIED LAIKLLDKDE
LVSKSKKRYY VNSLQHRVKN RVWQTLLVLF PRLDQNFLNG IIDRIFQAGF
TNNQASIKYF IEWIIILILH KFPQFLPKFW DCFSYGEENL KTSICTFLAV
LSHLDIITQN IPEKKLILKQ ALIVVLQWCF NHNFSVRLYA LVALKKLWTV
CKVLSVEEFD ALTPVIESSL HQVESMHGAG NAKKNWQRIQ EHFFFATFHP
LKDYCLETIF YILPRLSGLI EDEWITIDKF TRFTDVPLAA GFQWYLSQTQ
LSKLKPGDWS QQDIGTNLVE ADNQAEWTDV QKKIIPWNSR VSDLDLELLF
QDRAARLGKS ISRLIVVASL IDKPTNLGGL CRTCEVFGAS VLVVGSLQCI
SDKQFQHLSV SAEQWLPLVE VKPPQLIDYL QQKKTEGYTI IGVEQTAKSL
DLTQYCFPEK SLLLLGNERE GIPANLIQQL DVCVEIPQQG IIRSLNVHVS
GALLIWEYTR QQLLSHGDTK P
TARBP1
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBeRCSB
Список кодів PDB

2HA8

Ідентифікатори
Символи TARBP1, TRM3, TRP-185, TRP185, TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, TRMT3
Зовнішні ІД OMIM: 605052MGI:4936930HomoloGene:38082GeneCards:TARBP1
Онтологія гена
Молекулярна функція

methyltransferase activity
RNA methyltransferase activity
transferase activity
tRNA (guanine) methyltransferase activity
RNA binding
rRNA (guanosine-2′-O-)-methyltransferase activity

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

regulation of transcription by RNA polymerase II
Метилювання
RNA processing
tRNA methylation
enzyme-directed rRNA 2′-O-methylation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6894
212728
Ensembl
ENSG00000059588
н/д
UniProt
Q13395
E9Q368
RefSeq (мРНК)
NM_005646
NM_001159907
RefSeq (білок)
NP_005637
NP_001153379
Локус (UCSC) Хр. 1: 234.39 – 234.48 Mb н/д
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв’язування з РНК, s-аденозил-l-метіоніном.

. . . TARBP1 . . .

  • Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor R.B. (1995). Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.92: 7153 — 7157.PubMedDOI:10.1073/pnas.92.16.7153
  • Wu-Baer F., Lane W.S., Gaynor R.B. (1996). Identification of a group of cellular cofactors that stimulate the binding of RNA polymerase II and TRP-185 to human immunodeficiency virus 1 TAR RNA.. J. Biol. Chem.271: 4201 — 4208.PubMedDOI:10.1074/jbc.271.8.4201
  • Wu H., Min J., Zeng H., Plotnikov A.N. (2008). Crystal structure of the methyltransferase domain of human TARBP1.. Proteins72: 519 — 525.PubMedDOI:10.1002/prot.22065
  • Wu-Baer F., Lane W.S., Gaynor R.B. (1995). The cellular factor TRP-185 regulates RNA polymerase II binding to HIV-1 TAR RNA.. EMBO J.14: 5995 — 6009.PubMed
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11568 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
  4. UniProt, Q13395 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

. . . TARBP1 . . .

Ця стаття опублікована з веб-сайту Wikipedia. Оригінальна стаття може бути дещо скорочена або змінена. Можливо, деякі посилання були змінені. Текст ліцензований згідно з «Creative Commons – Attribution – Sharealike» [1], а деякі з текстів також можуть бути ліцензовані згідно з умовами «GNU Free Documentation License» [2]. До медіафайлів можуть застосовуватися додаткові умови. Використовуючи цей сайт, ви погоджуєтеся з нашими юридичними сторінками . Веб-посилання: [1] [2]

. . . TARBP1 . . .

Back To Top