BS

TRE-CTC1-5

Transferna RNK-Glu (CTC) 1-5 jest protein koji je kod ljudikodirangenomTRE-CTC1-5 sa hromosoma 1.[2]

TRE-CTC1-5
Identifikatori
Aliasi TRE-CTC1-5
Vanjski ID-jevi GeneCards: TRE-CTC1-5
Ortolozi
Vrste Čovjek Miš
Entrez

100189017

n/a

Ensembl

n/a

n/a

UniProt

n
a

n/a

RefSeq (mRNK)

n/a

n/a

RefSeq (bjelančevina)

n/a

n/a

Lokacija (UCSC) n/a n/a
PubMed pretraga [1] n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Transferna RNK (tRNK) predstavljaju najveću, najbolje shvaćenu klasu RNK gena koji ne kodiraju proteine koji se nalaze u svim živim organizmima. Dalko najznačajniji izvor novih tRNK je kompjuterska identifikacija gena unutar novosekvenciranih genoma. Kako bi organizirali brzo rastuću kolekciju i omogućili sistematske analize, u studiji iz 2016. kreirali su bazu podataka genomske tRNK (GtRNKdb), koja do sada uključuje preko 74.000 tRNK gena predviđenih za 740 vrsta. Web resurs pruža pregled statistike gena tRNK unutar svakog analiziranog genoma, uključujući informacije prema izotipu i genskom lokusu primarne sekvence koje se lahko preuzimaju, grafičkim sekundarnim strukturama i višestrukim poravnavanjima sekvenci. Direktne veze za svaki gen na UCSC pretraživaču eukariotskog i mikrobnog genoma pružaju grafički prikaz tRNK gena u kontekstu svih drugih lokalnih genetičkih informacija. Baza podataka može se pretraživati prema sličnosti primarne sekvence, karakteristikama tRNK ili filogenetskoj ]grupi. TheGtRNAdb 2.0: proširena baza podataka transfernih RNK gena identificiranih u kompletnim i nacrtnim genomima.[3]

Autori dalje konstatiraju da je alat za pretragu tRNAscan-SE postao de facto standard za označavanje gena tRNK u genomima, a genomska baza podataka tRNK (GtRNAdb) kreirana je kao portal za interaktivno istraživanje ovih predviđanja gena. Od svog objavljenog opisa 2009. godine, GtRNAdb je stalno rastao u sadržaju i ostaje najčešće citirani izvor informacija o genima tRNK na internetu. U novom ažuriranju opisuju ne samo značajno povećanje broja predviđanja tRNK (>367000) i analiziranih genoma (>4370), već, što je još važnije, integraciju novih analitičkih i funkcionalnih podataka za poboljšanje kvaliteta i biološkog konteksta tRNK predviđanja gena. Nove informacije iz drugih izvora uključuju podatke o modifikaciji tRNK, epigenetičke podatke, jednonukleotidne polimorfizme, [[[ekspresijja gena|ekspresiju gena]] i evolucijsku konzervaciju. Također je predstavljen bogatiji skup analitičkih podataka, uključujući bolje predviđanje funkcionalne tRNK, nekanonske karakteristike, predviđene strukturne uticaje iz varijanti sekvence i minimalna strukturna predviđanja slobodne energije. Pogledi tRNK gena u genomskom kontekstu pružaju se putem direktnih veza na UCSC pretraživače genoma. Baza podataka može se pretraživati prema sekvenci ili karakteristikama gena, a dostupna je javno dostupna na .

. . . TRE-CTC1-5 . . .

  1. “Human PubMed Reference:”. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  2. “Entrez Gene: Transfer RNA-Glu (CTC) 1-5”. Pristupljeno 2018-02-16.
  3. Patricia P Chan, Todd M Lowe (2009): GtRNAdb: a database of transfer RNA genes detected in genomic sequence. Nucleic Acids Res., 37(Database issue):D93-7; doi: 10.1093/nar/gkn787; pmid: 18984615; pmcid: pmc2686519: doi: 10.1093/nar/gkn787

. . . TRE-CTC1-5 . . .

This article is issued from web site Wikipedia. The original article may be a bit shortened or modified. Some links may have been modified. The text is licensed under “Creative Commons – Attribution – Sharealike” [1] and some of the text can also be licensed under the terms of the “GNU Free Documentation License” [2]. Additional terms may apply for the media files. By using this site, you agree to our Legal pages . Web links: [1] [2]

. . . TRE-CTC1-5 . . .

Back To Top